В 1957 году закончил Московский институт цветных металлов и золота, в 1964 году защитил кандидатскую, а в 1971 году - докторскую диссертации.

Профессор экономики, академик Национальной академии наук Республики Казахстан.

Заслуженный деятель науки, Лауреат Премии имени Чокана Валиханова.

Трудовую деятельность начал в 1958 году в Институте экономики Национальной академии наук.

В 1980 - 1994 годах руководил Советом по изучению производительных сил Национальной академии наук, где под его научным руководством были разработаны: Государственная программа по сохранению Аральского моря и восстановлению экологического равновесия Приаралья; Республиканская программа «Балхаш» по оздоровлению экологической обстановки и социально-экономического развития Или-Балхашского региона; Проект защиты народнохозяйственных объектов и населенных пунктов прибрежной полосы Каспийского моря; Комплексный прогноз научно-технического и социально-экономического развития Казахстана до 2015 года, и другие.

С 1996 года возглавлял Институт социальной экономики и финансов.

Основатель нескольких научных школ по направлениям: эффективность инвестиций; науковедение и экономика науки; развитие денежно-финансовой системы в условиях глобализации; социальная гармоничная экономика, и другие.

Владеет авторским правом на произведение науки «Қоғам мен экономика (әлемдіқ парадигма)» с 2013 года.

За научное открытие «Закон социально-экономической Гармонии» в 2014 году удостоен Дипломом на Открытие.

В 1990-1995 годах академик Баймуратов избирался депутатом Верховного Совета Республики Казахстан, где возглавлял Комитет по финансам, бюджету и банкам, был членом Координационного совета Верховного Совета.

Представлял Казахстан как заместитель председателя Совета Республик Верховного Совета СССР.

Был членом Постоянной комиссии Межпарламентской Ассамблеи государств-участников СНГ.

Академик Баймуратов активно участвовал в становлении современной казахской государственности, в подготовке и принятии Декларации о Суверенитете Казахстана, первой Конституции страны, Налогового и Таможенного кодексов, Законов о собственности, о Национальном банке, о Банках и банковской деятельности и многих других законов, в разработке первых правительственных программ по переходу к рыночным отношениям.

Еще в 1990 году обосновал и опубликовал идею триады о суверенитете Казахстана, переходе к рыночным отношениям и собственной национальной валюте «тенге».

Многие годы являлся Президентом Союза научных и инженерных объединений Казахстана. Был членом Союза журналистов и Союза ученых Казахстана. Руководил и состоял членом многих научных советов, редколлегий книг и журналов, в том числе входил в составы Международного совета журнала "Экономика региона" и Международного научно-практического журнала «Аудит».